La carrera de Biología Marina fue creada en el año 1996 en la Universidad de Los Lagos; fue concebida y creada como respuesta al desarrollo emergente de la Acuicultura en Chile y al creciente uso del borde costero, en particular en las Regiones de los Lagos, de Aysén y de Magallanes.

El proyecto académico de la carrera de Biología Marina, se empezó a elaborar al interior del Departamento de Acuicultura y Recursos Acuáticos a principios de los años 90, una vez que se hacía evidente que la actividad acuícola iba creciendo en el país, como así mismo, los problemas asociados a su desarrollo, muchos de los cuales requerían la participación de un profesional en biología marina con las características que se estaban incluyendo en la propuesta de creación. El proyecto es aprobado en las instancias ministeriales y se lleva a cabo en 1996. Sus particulares características y su evolución se explican principalmente por dos aspectos de contexto que han ocurrido en forma casi paralela: el desarrollo y evolución de la acuicultura nacional y los cambios estructurales y funcionales en la Universidad de Los Lagos